蓝藻纲—色球藻目
细菌域
细菌界
蓝菌门（蓝藻门）
蓝藻纲
色球藻目
色球藻目（）是蓝藻门蓝藻纲的一个目，有害微生物铜绿微囊藻即属于此目。当水中悬浮物高居不下、温度上升、氧气不足、氨氮浓度升高等因素使水质恶化时，这种藻类即会出现。
现有35个属，250种。绝大多数淡水产。分布极广，在各种生境中都能生存；水生的属种多数营浮游生活，或附着于水体中的物体上；亚气生及气生的属种，多数聚集成各式团块状，粘附在各种基质如石块、墙壁、树干、藓类以及比较大形的其他藻类植物体或其胶质分泌物上。有3个科：色球藻科()、石囊藻科()和蓝柄藻科 ()。色球藻科种类多，分布广，最常见的有：色球藻属()、粘球藻属（）、粘杆藻属()、束球藻属（）、腔球藻属()、平裂藻属（）、隐球藻属()、隐杆藻属()等，星球藻属(-capsa)为中国特有属，分布于西南、华南各省。
下属科：
色球藻科（）
蓝柄藻科（）
蓝菌科（）
石囊藻科（）
真囊球藻科（）
微囊藻科（）
1.色球藻科
色球藻科（学名： ）为色球藻目的一个科。此科的模式属为色球藻属()。
色球藻属（学名：）为色球藻科的一个属。此属的模式种为淡红色球藻( )。
细胞球形，近球形,刚分裂后呈半球形;一般由2、4、8、16或更多的细胞组成的群体,细胞内的原生质体为同质的,或含小颗粒体；原生质体呈各种颜色，灰蓝、淡蓝、蓝绿、橄榄绿、黄、橘黄、红或紫红色；每个细胞外都有均质的或有层理的胶鞘；坚固或柔弱而透明。细胞分裂面有3个。
中国已报道的有18种，淡水或海洋都有生长，水生和亚气生多于气生，水生的营浮游或附着生活，亚气生的往往与他种蓝藻如念珠藻等混生，或生长于藓类的茎叶间，有时大量出现成为优势种。
2.蓝柄藻科（1）巨大蓝柄藻
巨大蓝柄藻（ H. W. Liang），蓝柄藻科蓝柄藻属，生长在潮湿岩土上。
原植体具单一或双叉的，无色透明的胶质柄；胶质柄短而健壮，近圆锥形，具粗而明显的层理。细胞巨大，球形或近球形，在分裂后呈半球形，不包括胶被时的直径达（20－）46.8－52.5μm，单一或二个细胞集合在一起，位于胶柄的顶端；个体胶被宽厚达（2.5－）7.2－12.5μm，个体和公共胶被均坚固，无色透明，并具多层十分显的层理。原生质体内有小颗粒体，黄褐色、桔红色至棕红色。
国内分布：福建（崇安）。
（2）中华蓝柄藻
中华蓝柄藻（ Chu），蓝柄藻科蓝柄藻属，生长在山区滴水岩石或潮湿岩石表，枯树干表面，常与多种蓝藻混生于苔藓植物间。
植物团块为柔软的皮壳状小堆体积，蓝绿色。细胞球形、半球形、长圆形或椭圆形，直径为2.5－9μm，一般位于粗短的胶质柄的顶端。细胞单一或2、4至8个细胞聚在一起；胶被无色或微淡绿色，具有明显或不十分明显的层理；胶柄圆柱型、圆锥形或不规则型，层理明显。原生质体均匀，或有微小的颗粒，橄榄绿色或亮绿色。
国内分布：安徽（黄山、大别山区岳西）、福建（武夷山）、湖北（五峰）、广东、海南（黎母岭、吊罗山）、广西（桂林七星岩）、四川（峨眉山）。
3.石囊藻科
石囊藻科（学名：）为色球藻目的一个科。此科的模式属为石囊藻属()。
石囊藻属（学名： ）为石囊藻科的一个属。此属的模式种为颗粒石囊藻( )。
颗粒石囊藻（a Kützing），石囊藻科石囊藻属，生长于滴水岩石、瀑布旁水花溅及的石表。
植物团块为皮壳状体，由无数微小的颗粒集合而成，厚达1mm，褐黑色或黄褐色；细胞球形，不连胶被的直径为2－4.8μm，具黄至褐色的胶被；伪丝体由2－4－8个细胞组成，具明显或不明显层理的胶被；堆积性伪枝明显，长而直立，略作平行排列；原生质体均匀，蓝绿色或橄榄绿色。
国内分布：福建（平潭）、广东（鼎湖山）、海南（黎母岭）、四川（金佛山）。
4.真囊球藻科
真囊球藻科（学名： ）为色球藻目的一个科。此科的模式属为真囊球藻属()。
真囊球藻属（学名：）也称束球藻属，为真囊球藻科的一个属。此属的模式种为圆胞束球藻( )。
5.微囊藻科
微囊藻科（学名：）为色球藻目的一个科。此科的模式属为微囊藻属()。
（1）微囊菌属
微囊菌属（学名：）也称微囊菌属，是色球藻目蓝菌的一个属，常见于淡水中，其中包含会造成有害藻华的铜绿微囊菌（ ），其毒素会导致肝脏、胆囊病变。
如命名所显示，微囊藻的特征是小型的细胞，且没有鞘的包覆。细胞常聚集成大至肉眼可见的群落，本为圆形，但随细胞数增多会逐渐出现孔洞并变不规则。其原生质体的颜色为浅蓝绿色，但充满气体的囊泡常会呈暗色，这是在光学显微镜下用来鉴别微囊菌的特征之一。
群体为球形、长圆形，形状不规则网状或窗格状，微观或肉眼可见。群体具无色、柔软而有溶解性的胶被。细胞球形或长圆形，多数排列紧密；细胞淡蓝绿色或橄榄绿色，往往有气泡（假空胞）。
自由漂浮于水中，或附着于水中的各种基质上。多数生活于各种淡水中，罕生于海水或盐水中，在某些种的大量繁殖时，往往在水面形成一种绿色的粉末状团块，称做水华。
有25种，中国有18种。其中有不少种是世界性分布的种类。
（2）铜绿微囊藻
铜绿微囊藻（学名：a）是一种出现在淡水中的蓝菌，会产生有害藻华，具有一定的生态学与经济重要性。铜绿微囊藻是在优养化的淡水中最常见的有毒蓝菌藻华来源。
如同其学名显示的，微囊藻属的特征为小型的细胞，细胞大小仅有3至8微米，且其外没有鞘包覆。细胞常聚集成肉眼可见的群落，这些群落本为圆形，经过时间发展可能会产生孔洞并呈不规则形状。原生质体的颜色是浅蓝绿色，但因细胞中具有充满空气的囊泡在光下可能呈暗色，这是光学显微镜下微囊藻的鉴别特征之一。囊泡提供微囊藻足够的浮力，使其停留在有足够光线和二氧化碳提供生长的水层。
铜绿微囊藻较偏好高温，但毒性与最高生长率不一定有关联，在实验室培养中，摄氏32度具有最高的生长率，但毒性最强的温度是摄氏20度。温度低于摄氏15度时其生长会被显著的抑制。除了毒素外，微囊藻形成藻华时淡水溶氧量的显著降低也会导致水中动物的死亡。
一种水生被子植物聚藻可以产生鞣花酸、没食子酸、连苯三酚和儿茶素，这些聚酚化合物可产生化感作用，对铜绿微囊藻的生长产生抑制。
铜绿微囊藻可以产生神经毒素脂多糖[7]与肝毒素微囊藻素。微囊藻素是一些环状非核糖体多肽的合称，由脱氢丙氨酸衍生物和ADDA氨基酸等非蛋白氨基酸组成，可强烈抑制第一型与第二型蛋白质磷酸酶，对动植物都有毒性，对肝脏的毒性很强，也和全脂炎有关。
由于在理想的环境下铜绿微囊藻可以持续产生对肝有害的微囊藻素，其为饮用水污染的来源之一，且这种毒素对热的抗性高，甚至以活性碳吸附、加入氯或臭氧消毒也无法完全消除。对经济的影响包括为了减轻毒素需要在净水上花费的额外成本，和发生有害藻华的河湖需暂时封闭对当地旅游业造成伤害。
也有研究显示铜绿微囊藻可以产生2,6-二叔丁基对甲酚，这种物质主要在食品添加剂中被用作为抗氧化剂，在工业上也具有许多用途。
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